دوره کارشناسی ارشد آموزش بهداشت این دانشکده در سال 1390 با پذیرش 7 دانشجو راه اندازی گردید و در حال حاضر با استفاده از اساتید مجرب داخل و خارج از دانشگاه و با بهره گیری از تجربیات اساتید دانشگاه هایی از جمله دانشگاه تهران، تربیت مدرس و دانشگاه خلیج فارس مسیر رشد و تعالی خود را ادامه می دهد.