دانشكده بهداشت دانشگاه علوم پزشکی بوشهر فعاليت خود را رسماً در سال 1369 با پذیرش دانشجو در مقطع کاردانی رشته مبارزه با بیماری ها آغازكرد. درسال 1371 با پذیرش دانشجو در مقطع کاردانی بهداشت محیط و بهداشت خانوارده به فعالیت خود ادامه داد. گروه مهندسی بهداشت محیط از سال 1371 در دانشکده بهداشت تاسیس گردید و همراه با اعتلاي سطح آگاهيها در زمينه بهداشت محيط زيست، فعاليت اين گروه نيز به صورت روزافزون گسترش يافته است. همچنین این گروه، دوره کاردانی را از سال 1371، دوره کارشناسی ناپیوسته از سال 1373، دوره کارشناسی پیوسته از سال 1386، دوره کارشناسی ارشد از سال 1392 اقدام به پذیرش دانشجو نمود و در حال حاضر گروه مهندسي بهداشت محيط هر ساله در دو مقطع کارشناسی پیوسته و کارشناسی ارشد دانشجو مي‌پذيرد. ضمنا، اولین دانشجوی دکتری پژوهشی (by-research) خود را نیز در سال 1397 پذیرش کرد.